Еще в царствование Петра Великого В Москве на реке Яузе плавали струги, "дедушка русского флота" открывал на этой реке навигацию. В те времена Яуза была широка и глубока, а берега ее были покрыты густыми лесами. Один из крутых берегов Яузы, находящийся на четвертой версте от Кремля, отличался особенной красотой. Построение этой обители относится к княжению Дмитрия Иоанновича и святительству Алексия митрополита, а поводом к тому было чудесное спасение этого святителя в водах Черного моря летом 1356 году, во время возвращения его из Царьграда. Вернувшись в Москву, святитель обратился за помощью по вопросу о сооружении обители к великому святителю Земли Русской игумену Троицкой обители Сергию. Игумен согласился принять участие в постройке и дал в строители монастыря ученика своего Андроника. Первый храм был построен в 1360 году, а игуменом был назначен преп. Андроник, как достойный преемник иноческих подвигов своего великого учителя, к которому он еще в юности пришел из города Ростова для восприятия ангельского образа.
Чин в монастыре, по примеру обители Сергия, установлен был общежительный: общий для всех трудов, общая трапеза, безусловное послушание и общая молитва. В тяжелые годы испытаний, пережитых Русью, Спасо-Андрониев монастырь подвергался то набегам татар, то разорению от поляков, то разгрому от французов. Грозное нашествие Тохтамыша в 1383 году едва в конец не разорило обитель.
Дальнейшая история Спасо-Андроникова монастыря вся полна всевозможными бедствиями и лишениями: неоднократно обитель грабилась, лишь в нача-ле 19 столетия монастырь начал приходил в цветущее состояние.
Поначалу монастырь был деревянной крепостью. В конце 14- начале 15 вв. в монастыре воздвигли белокаменный собор. На территории монастыря расположено еще три храма: храм во имя Архангела Михаила; церковь Рождества Пресвятой Богородицы и храм в честь св. Симеона, находящийся в колокольне. В 14-17 веках один из центров переписки книг. В обители под спудом покоятся мощи преп. Андроника, основателя монастыря, и в той же раке почивают честные останки св. Саввы, приемника св. Андроника и второго игумена монастыря. С Андрониковым монастырем связана память о величайшем художнике Древней Руси - Андрее Рублеве. Здесь он жил, работал и здесь, у стен Спасского собора, похоронен в 1430 г. От фресок Рублева сохранились лишь орнаментальные росписи на откосах окон в алтаре Спасского собора. Угловатые части здания резко понижены, в то время как центральные своды решительно и сильно подняты, образуя крестообразный объем. Над серединой этого объема поднимается квадратное основание главы, крутыми арками вздымающееся кверху и переходящее в восьмигранник, который уже венчается цилиндрическим барабаном. Устремленность ввысь этой ярусной композиции подчеркнута килевидным очертанием закомар, размеры которых убывают кверху. Внешний объем собора точно передает построение его внутреннего пространства с высокими сводами по главным осям и приподнятыми над ними арками, несущими барабан. Арки эти опираются на стройные столбы. Хоры, на которых обычно уст-раивалось изолированное от толпы место для князя и его ближних, отсутствуют, как нет и темных, придавленных пространств под хорами.
В 1504-1506 гг. в монастыре была возведена трапезная - массивный, почти кубический объем с лаконичной гладью мощных стен, прорезанных скупыми оконцами. Центральный столп поддерживает тяжелые своды трапезной палаты на втором этаже, имеющей площадь около 200 м. Здание, выступавшее за пределы стен, было сначала постройкой число гражданского характера. Лишь в 1694 г. к трапезной с восточной стороны была пристроена трехъярусная церковь в стиле московского барокко, получившая завершение уже в 1739 г. Стены и нижние ярусы башен монастыря относятся ко второй половине 17 в.
На территории монастыря сохранилась могила создателя русского профессионального театра актера Ф. Г. Волкова, а также размещается Музей древне-русского искусства им. Андрея Рублева.