По возвращении из Бразилии Фердинанд Келлер в 1862 году поступил в Художественную школу в Карлсруэ и учился у Иоганна Вильгельма Ширмера, занимавшего тогда должность директора школы. После смерти Ширмера в 1863 году Келлер продолжил учёбу под руководством Людвига де Кудре. Недовольный результатами учёбы, Келлер в 1864 году брал частные уроки в мастерской Ганса Канона. В 1866 году Фердинанд Келлер отправился в образовательную поездку по Швейцарии и Франции. В 1867—1869 годах Келлер жил в Риме, где познакомился с Ансельмом Фейербахом. Келлер и Фейербах держали свои мастерские в одном доме.

 

В 1870 году Фердинанд Келлер был назначен преподавателем портретной и исторической живописи в Академии художеств в Карлсруэ. В 1873 году получил звание профессора, среди его учеников был Карл Гейст. В 1880—1913 годах Келлер занимал должность директора Академии художеств. Умер в 79 лет в Баден-Бадене.

 

Первый крупный успех пришёл к Келлеру в 1867 году с историческим полотном «Смерть короля Филиппа II Испанского». В многочисленных монументальных картинах Келлер восхвалял исторические, династические и культурные события в жизни Германии и Бадена. Картина «Апофеоз кайзера Вильгельма I» размером пять на семь метров была создана Келлером в 1888 году и спустя год приобретена кайзером Вильгельмом II. Работы Фердинанда Келлера украшают залы Баденского государственного театра и дрезденской Оперы Земпера. Другие известные работы художника — «Нерон, любующийся пожаром Рима» (1873), «Победа маркграфа Людвига Вильгельма Баденского при Заланкемене в 1691 году» и «Геро и Леандр» (1880).