Строили храм при легендарном настоятеле Филиппе. Пришел он в монастырь, назвался пастухом и остался послушником, потом принял иночество. Оказалось, грамоте обучен и знает много. Дело в том, что пастушествовал он год, а до этого жил Филипп Колычев в знатной боярской семье в Москве. А на Север бежал, спасаясь от царского гнева. Вот и стал он строителем - построил кирпичный завод, создал ферму на соседнем острове, чтобы кормить работников и строителей (у монахов круглый год строгий пост), соединил Святое озеро с 54 озерами острова каналами, так как рек на острове нет - даже вода за тысячелетия не смогла промыть гранитные валуны. Каналы собирали воду в Святое озеро, а из него - в бухту. Эта вода крутила мельницу, лесопилку, а уже в 20 веке - и одну из первых в России гидроэлектростанций.
Но вернусь к собору. Он уникален с точки зрения архитектуры. В нем всего два столпа. Обычно храмы четырех или шестистолпные. Два столпа закрывают иконостасом, создавая преграду, за которой святое место. В Преображенском соборе иконостас размещен прямо на восточной стене, а апсиды пристроены снаружи и в них ведут двери. В соборе целых семь престолов, то есть церквей - самые верхние - в главках, и к ним ведум лестницы в стенах храма. Стены очень толстые. Строили "на глазок" с огромным запасом прочности. Окон непривычно много, и они большие. Храм не отапливался, холод зимой страшный.