Купола на твоем снимке русского, а не византийского, происхождения. Византийский купол, как и любой на Востоке, это сфера. К примеру, храм Святой Софии в Константинополе. Полумесяц под крестом символизирует евхаристическую Чашу (в которую стекает Кровь Христова, в этом случае Крест часто обвит виноградной лозой, ведь евхаристия служится на разбавленном водой вине). Позже стала символизировать купель, ибо Крещение неразрывно связанно с Крестом и Воскресением, смертью для греха и вечная жизнь для Бога. Думаю, в это же время появляется значение корабля, крест тогда рассматривается как мачта. Церковь часто рассматривается в символике корабля (Ноева ковчега) плывущего по волнам житейского моря. Самый поздний вариант, это победа Креста над исламским полумесяцем, возникнуть такой смысл мог только на Востоке во время богословского упадка (16-19вв) когда весь Восток был под Турецким игом. Могу предположить связь данной формы креста (с полумесяцем) и древним символом христианства (Якорем), вспомним, что апостолы, в большинстве своем были рыбаками.