Заиконоспасский монастырь в Москве был основан в 1600 году Борисом Федоровичем Годуновым, но первое документальное упоминание об этой обители относится к 1635 году. Известно, что раньше, еще в 14 веке на месте Заиконоспасского монастыря существовал древний монастырь Николы Старого. Такое название монастырь получил от своего месторасположения - он был построен за иконным рядом в Китай-городе, который вплоть до 1682 года функционировал на Никольском Крестце.

Заиконоспасский мужской монастырь называли ″учительским″. Об был известен тем, что по повелению царя Алексея Михайловича здесь в 1686 году открыта школа, которую возглавил Симеон Полоцкий. В школе ученикам давали обширные знания, включающие многие науки, а позднее она была преобразована в училище. Начиная с 1686 года по 1814 год здесь находилась известная Славяно-греко-латинская Академия, открытая греками, братьями Лихудами – Иоанникием и Софронием. Братья иеромонахи провели весь остаток дней в Заиконоспасской обители, а после сметри здесь же и были похоронены. Имена многих выпускников этого учебного заведения вошли в историю. Здесь учились М.Ломоносов, В. Баженов, Л. Магницкий и А. Кантемир.

Центральный храм Заиконоспасского монастыря – Спасский собор – был построен в одно время с основанием обители. Освятили Спасский собор 20 ноября 1661 года. Спасский собор в первоначальном виде не сохранился, его несколько раз перестраивали. Впервые это случилось ориентировочно в 1711-1720 годах – именно этот вариант Спасского собора можно видеть сейчас. Наверху собора была устроена придельная церковь в честь иконы Божией Матери Всех Скорбящих Радость. Нижний, Спасский храм имел вход со стороны монастырского двора. Нижний храм необычайно мрачный – это объясняется практически полным отсутствием дневного света, который не пропускают монастырские стены и строения, окружающие храм с трех сторон.

В 1737 году при пожаре Спасский храм значительно пострадал, но был восстановлен и вновь освящен в 1742 году. В 1812 году Заиконоспасский монастырь разграбили наполеоновские солдаты, а спустя 2 года, когда Академию перевели в Троицко-Сергиевскую Лавру, Заиконоспасская обитель стала приходить в упадок, хотя, нужно отметить, что в 1851 году в Спасском храме проводились ремонтно-восстановительные работы. В 1884 году здесь было открыто училище для детей духовенства.

После Октябрьской социалистической революции жизнь Заиконоспасского монастыря изменилась. В 1920 году здесь располагался центр Союза церковного возрождения, но уже в 1929 году монастырь закрыли. А раньше, в 1924 году снесли монастырскую колокольню. Несколько десятилетий на территории обители располагались различные учреждения, а в 1960 году началась реставрация собора Спаса Нерукотворного. Верхний ярус храма перестроили, а вместо креста на куполе был установлен позолоченный штырь.

До нашего времени от комплекса Заиконоспасского монастыря помимо собора сохранилось здание бывшего духовного училища и трехэтажный Братский корпус. В 1992 году храм был возвращен церкви, и в этом же году здесь возобновились богослужения. Сейчас Спасский храм считается патриаршим подворьем, здесь работает воскресная школа. Сейчас многие помещения заняты различными недуховными учреждениями. В их числе Историко-архивный институт РГГУ, ресторан Годунов, почтамт, но в ближайших планах у церкви - возобновление монастырской жизни в Заиконоспасской обители.