Çà âðåìÿ âîéíû Èîñèô Ñòàëèí 41 ðàç îáúÿâëÿë ëè÷íóþ áëàãîäàðíîñòü Æóêîâó. Ìàðøàë ïðèíèìàë ïàðàä Ïîáåäû è ïîäïèñûâàë áóìàãè î êàïèòóëÿöèè Ãåðìàíèè. Îäíàêî ñðàçó ïîñëå âîéíû Æóêîâ ïîïàë â îïàëó.
11 èþëÿ 1941 ãîäà Ñòàëèí ïèøåò â Êèåâ Õðóùåâó: "Ïîëó÷åíû äîñòîâåðíûå ñâåäåíèÿ, ÷òî âû âñå, îò êîìàíäóþùåãî Þãî-Çàïàäíûì ôðîíòîì äî ÷ëåíîâ Âîåííîãî Ñîâåòà, íàñòðîåíû ïàíè÷åñêè è íàìåðåíû ïðîèçâåñòè îòâîä âîéñê íà ëåâûé áåðåã Äíåïðà. Ïðåäóïðåæäàþ âàñ, ÷òî, åñëè âû ñäåëàåòå õîòü îäèí øàã â ñòîðîíó îòâîäà âîéñê íà ëåâûé áåðåã Äíåïðà, íå áóäåòå äî ïîñëåäíåé âîçìîæíîñòè çàùèùàòü ðàéîíû ÓÐîâ íà ïðàâîì áåðåãó Äíåïðà, âàñ âñåõ ïîñòèãíåò æåñòîêàÿ êàðà êàê òðóñîâ è äåçåðòèðîâ".
Ãåîðãèé Æóêîâ íå ìîã íå çíàòü îá ýòîé òåëåãðàììå Ñòàëèíà (îíà áûëà îòïðàâëåíà ÷åðåç óçåë ñâÿçè Ãåíøòàáà), îäíàêî óæå 29 èþëÿ íà ñîâåùàíèè ñî Ñòàëèíûì îí óëüòèìàòèâíî çàÿâèë, ÷òî Êèåâ íåîáõîäèìî îñòàâèòü.
 êíèãå èñòîðèêà è áûâøåãî îôèöåðà ÃÐÓ Âëàäèìèðà Êàðïîâà "Ìàðøàë Æóêîâ, åãî ñîðàòíèêè è ïðîòèâíèêè â ãîäû âîéíû è ìèðà" ýòîò ýïèçîä ðàñêðûò ïîäðîáíî. Âñïîìèíàë åãî è Æóêîâ â ñâîèõ ìåìóàðàõ.
Ñòàëèí áûë â ãíåâå è ïåðåñïðîñèë: "Êàê âû ìîãëè äîäóìàòüñÿ ñäàòü âðàãó Êèåâ?", íà ÷òî Æóêîâ âñïûëèë: " Åñëè âû ñ÷èòàåòå, ÷òî ÿ êàê íà÷àëüíèê Ãåíåðàëüíîãî øòàáà ñïîñîáåí òîëüêî ÷åïóõó ìîëîòü, òîãäà ìíå çäåñü äåëàòü íå÷åãî. ß ïðîøó îñâîáîäèòü ìåíÿ îò îáÿçàííîñòåé íà÷àëüíèêà Ãåíåðàëüíîãî øòàáà è ïîñëàòü íà ôðîíò, òàì ÿ, âèäèìî, ïðèíåñó áîëüøå ïîëüçû Ðîäèíå". Ñòàëèí ïîñîâåòîâàë Æóêîâó íå ãîðÿ÷èòüñÿ, è äîáàâèë: "Ìû áåç Ëåíèíà îáîøëèñü, à áåç âàñ òåì áîëåå îáîéäåìñÿ... Èäèòå ðàáîòàéòå, ìû òóò ïîñîâåòóåìñÿ è òîãäà âûçîâåì âàñ".
Ïîñëå ïåðåðûâà ê çàñåäàâøèì Ìàëåíêîâó è Ìåõëèñó äîáàâèëñÿ Ëàâðåíòèé Áåðèÿ. Íè÷åãî õîðîøåãî ýòî íå ïðåäâåùàëî.  èòîãå, íà÷àëüíèêîì Ãåíøòàáà ñòàë Øàïîøíèêîâ, à Æóêîâ áûë íàçíà÷åí êîìàíäóþùèì Ðåçåðâíûì ôðîíòîì. Íà ýòîé äîëæíîñòè îí, îäíàêî, ïðîáûë íåäîëãî.
30 àâãóñòà - 8 ñåíòÿáðÿ 1941 ãîäà Æóêîâ ïðîâåë ïåðâóþ óñïåøíóþ Åëüíèíñêóþ íàñòóïàòåëüíóþ îïåðàöèþ è 11 ñåíòÿáðÿ áûë íàçíà÷åí êîìàíäóþùèì Ëåíèíãðàäñêèì ôðîíòîì.
Îñàäîê, îäíàêî, îñòàëñÿ. Êîíôðîíòàöèÿ Æóêîâ-Ñòàëèí ïîëó÷èëà ðàçâèòèå, íî áûëà "çàìîðîæåíà" äî êîíöà âîéíû.
Ðàñöåíèâàòü ïîñëåâîåííóþ îïàëó Æóêîâà òîëüêî â êîíòåêñòå çàòàåííîé îáèäû è ïîäîçðèòåëüíîñòè Ñòàëèíà áûëî áû íåïðàâèëüíî. Áûëè è äðóãèå "ôèãóðàíòû", èãðàâøèå ñâîè ðîëè.  ïåðâóþ î÷åðåäü, ýòî ãåíåðàë Àáàêóìîâ, Ãåîðãèé Ìàëåíêîâ è Ëàâðåíòèé Áåðèÿ.
Ïåðâûé ñ çàâèäíûì ðâåíèåì èñêàë êîçûðè ïðîòèâ Æóêîâà.  íîÿáðå 1945 ãîäà Æóêîâ ïðîâåë áîëüøóþ âîåííî-èñòîðè÷åñêóþ êîíôåðåíöèþ; íå óñïåëè å¸ ãîñòè ðàçúåõàòüñÿ, êàê â ðàñïîëîæåíèå ãðóïïû âîéñê ïðèáûë Àáàêóìîâ è ïðèíÿëñÿ, íå äîëîæèâ îá ýòîì Æóêîâó, ïðîâîäèòü àðåñòû îôèöåðîâ è îáûñêè. Æóêîâ âûãíàë Àáàêóìîâà âîñâîÿñè.
Ïî ïðèáûòèè â Ìîñêâó Àáàêóìîâ, êîíå÷íî, ïîøåë ñ äîêëàäîì ê Ñòàëèíó.  ìàðòå 1946 ãîäà ìàðøàë Æóêîâ ïîçâîíèë Ñòàëèíó è ïîëó÷èë óêàçàíèå âåðíóòüñÿ â Ìîñêâó è çàíÿòü äîëæíîñòü êîìàíäóþùåãî ñóõîïóòíûìè âîéñêàìè.
31 ìàÿ 1946 ãîäà ñîñòîÿëñÿ Âûñøèé âîåííûé ñîâåò, íà êîòîðîì ïðîòèâ Æóêîâà áûëè âûäâèíóòû îáâèíåíèÿ, êîòîðûå îñíîâûâàëèñü íà ìàòåðèàëàõ äîïðîñà Ãëàâíîãî ìàðøàëà àâèàöèè À. À. Íîâèêîâà, àðåñòîâàííîãî ïåðåä òåì îðãàíàìè ãîñáåçîïàñíîñòè ïî "äåëó àâèàòîðîâ". Ïîêàçàòåëüíî, ÷òî ìàòåðèàëû äîïðîñà Íîâèêîâà áûëè íàçâàíû íà Âîåííîì ñîâåòå "ïèñüìîì".
Ìàðøàë Àëåêñàíäð Íîâèêîâ ïîçæå âñïîìèíàë, êàê áûëè äîáûòû ýòè ïîêàçàíèÿ. "Ìîðàëüíî íàäëîìëåííûé, äîâåäåííûé äî îò÷àÿíèÿ íåñïðàâåäëèâîñòüþ îáâèíåíèÿ, áåññîííûå íî÷è... Íå óñíåøü, ïîñòîÿííûé ñâåò â ãëàçà... Íå òîëüêî ïî ïðè÷èíå äîïðîñîâ è íåðâíîãî íàïðÿæåíèÿ, ÷ðåçìåðíàÿ óñòàëîñòü, àïàòèÿ, áåçðàçëè÷èå è ðàâíîäóøèå êî âñåìó — ëèøü áû îòâÿçàëèñü — ïîòîìó è ïîäïèñàë — ìàëîäóøèå, íàäëîìëåííàÿ âîëÿ. Äîâåëè äî ñàìîóíè÷òîæåíèÿ. Áûëè ìèíóòû, êîãäà ÿ íè÷åãî íå ïîíèìàë... ÿ êàê â áðåäó íàãîâîðèë áû, ÷òî òàêîé-òî õîòåë óáèòü òàêîãî-òî".
Æóêîâ áûë îáâèí¸í â íåçàêîííîì ïðèñâîåíèè òðîôååâ è ðàçäóâàíèè ñâîèõ çàñëóã â äåëå Ïîáåäû íàä ôàøèñòñêîé Ãåðìàíèåé ñ ëè÷íîé ôîðìóëèðîâêîé È. Â. Ñòàëèíà "ïðèñâàèâàë ñåáå ðàçðàáîòêó îïåðàöèé, ê êîòîðûì íå èìåë íèêàêîãî îòíîøåíèÿ".
9 èþíÿ 1946 ãîäà ìàðøàëà Æóêîâà ñíèìàþò ñ äîëæíîñòè Ãëàâêîìó ñóõîïóòíûõ âîéñê è îòïðàâëÿþò ôàêòè÷åñêè â ññûëêó - êîìàíäîâàòü Îäåññêèì âîåííûì îêðóãîì.

Íà îäåññêèé ïåððîí ïðèáûëè äâà ëèòåðíûõ âàãîíà è ïëàòôîðìà ñ àâòîìîáèëÿìè Æóêîâà. Ìàðøàë ïðèåõàë ñ äî÷åðüþ. Ïî ïðèáûòèè Æóêîâ ñðàçó ïîåõàë äîëîæèòüñÿ â îáêîì ïàðòèè.
Îäåññêèé ïåðèîä æèçíè ìàðøàëà çàïîìíèëñÿ, ïðåæäå âñåãî, åãî áîðüáîé ñ îäåññêîé ïðåñòóïíîñòüþ. Ñèòóàöèÿ ñ íåé â ïîñëåâîåííîé Îäåññå áûëà êðèòè÷åñêîé, ïîýòîìó è ìåðû (ïðåæäå âñåãî àäìèíèñòðàòèâíîãî õàðàêòåðà) òðåáîâàëèñü íåîðäèíàðíûå. Æóêîâûì áûëà èíèöèèðîâàíà îïåðàöèÿ "Ìàñêàðàä". Äëÿ ïîèìêè ïðåñòóïíèêîâ ñîòðóäíèêè ïåðåîäåâàëèñü â ãðàæäàíñêóþ îäåæäó, èñïîëüçîâàëè ïðèåì "ëîâëè íà æèâöà", íà ìåñòå ðàñïðàâëÿÿñü ñ áàíäèòàìè.
Æóêîâ èç Îäåññû ïèñàë â ïèñüìå Ñòàëèíó: "Íà çàñåäàíèè âûñøåãî âîåííîãî ñîâåòà ÿ äàë Âàì ñëîâî â êðàò÷àéøèé ñðîê óñòðàíèòü äîïóùåííûå ìíîþ îøèáêè, è ÿ ñâîå ñëîâî âûïîëíÿþ. Ðàáîòàþ â îêðóãå ìíîãî è ñ áîëüøèì æåëàíèåì. Ïðîøó Âàñ, òîâàðèù Ñòàëèí, îêàçàòü ìíå ïîëíîå äîâåðèå, ÿ Âàøå äîâåðèå îïðàâäàþ".
Íå ïðèâûêøèé íè÷åãî äåëàòü â ïîëñèëû, Æóêîâ â Îäåññå âåë ñåáÿ äàæå ñëèøêîì äåÿòåëüíî. Îí ïðèíÿëñÿ ðåøàòü âîïðîñû æèëüÿ äëÿ ñëóæàùèõ, ââåë ñòðîæàéøóþ äèñöèïëèíó íà ââåðåííîì åìó ó÷àñòêå.
Êîíå÷íî, íà÷àëèñü æàëîáû, êîòîðûå â êîíöå êîíöîâ äîøëè è äî Ìîñêâû. Áóëãàíèí ëè÷íî ïðèåõàë ñ ïðîâåðêîé â Îäåññó, íî íè÷åãî ñåðüåçíîãî íà îïàëüíîãî ìàðøàëà ñíîâà íå óäàëîñü íàéòè. Ñòàëî î÷åâèäíî, ÷òî ìàðøàëà Æóêîâà îäíèì "äåëîì àâèàòîðîâ" íå ñâàëèòü.
 1948 ãîäó íà Æóêîâà çàâåëè "òðîôåéíîå äåëî". Åìó âìåíÿëîñü íåçàêîííîå ïðèñâîåíèå öåííîñòåé è òðîôååâ, âûâîç èç Ãåðìàíèè ìåáåëè, êàðòèí è äðóãîãî èìóùåñòâà. Òàêîå ïîâåäåíèå áûëî íàçâàíî "íåïàðòèéíûì". Æóêîâ íàïèñàë îáúÿñíèòåëüíóþ çàïèñêó íà èìÿ Æäàíîâà: "ß ïðèçíàþ ñåáÿ î÷åíü âèíîâíûì â òîì, ÷òî íå ñäàë âñ¸ ýòî íåíóæíîå ìíå áàðàõëî êóäà-ëèáî íà ñêëàä, íàäåÿñü íà òî, ÷òî îíî íèêîìó íå íóæíî".
Ê ñëîâó, öåííîñòåé ó Æóêîâà äåéñòâèòåëüíî áûëî íàéäåíî íåìàëî. Âî âðåìÿ êîíôèñêàöèè áûëè èçúÿòû 194 ïðåäìåòà ìåáåëè, 44 êîâðà è ãîáåëåíà, 7 ÿùèêîâ ñ õðóñòàëåì, 55 ìóçåéíûõ êàðòèí, 4000 ìåòðîâ òêàíè, 323 ìåõîâûõ øêóðêè.
Ïðèêàç î íàçíà÷åíèè Æóêîâà íà äîëæíîñòü êîìàíäóþùåãî Óðàëüñêèì âîåííûì îêðóãîì áûë ïîäïèñàí ìèíèñòðîì âîîðóæåííûõ ñèë Áóëãàíèíûì 4 ôåâðàëÿ 1948 ãîäà. Ïî âîñïîìèíàíèÿì Æóêîâà, îí çíàë, ÷òî ïîä íåãî "ðîþò", ïîýòîìó âåë ñåáÿ â Ñâåðäëîâñêå èñêëþ÷èòåëüíî ïî óñòàâó, íå ïîçâîëÿÿ ñåáå íèêàêîé ðîñêîøè. Äàæå ñïàë ÷óòü ëè íå íà ñîëäàòñêîé ðàñêëàäóøêå.
Êîíòðàñòíî â ñðàâíåíèè ñ òàêèì áûòîì âûãëÿäåëî òî, ñ êàêèì âîñõèùåíèåì ê Æóêîâó îòíîñèëèñü ñâåðäëîâ÷àíå. Âî âðåìÿ ïåðâîìàéñêîãî ïàðàäà 1948 ãîäó êîëîííà ëþäåé íàäîëãî çàñòîïîðèëàñü íà ïëîùàäè ó òðèáóíû, ãäå ñòîÿë ìàðøàë Ïîáåäû. Íàðîä ñêàíäèðîâàë: "Æóêîâ! Æóêîâ!".
Îáëàñòíîå íà÷àëüñòâî ñäåðæàííî îòíîñèëîñü ê òàêèì ïðîÿâëåíèÿì ëþáâè è íå çíàëî, êàê íóæíî ïðàâèëüíî ðåàãèðîâàòü. Âñ¸-òàêè îïàëüíûé ìàðøàë...
Æóêîâ äî êîíöà ñâîåé æèçíè íå ñòàâèë â âèíó Ñòàëèíó òå ïåðèïåòèè, êîòîðûå åìó ïðèøëîñü ïåðåæèòü.  îêòÿáðå 1952 ãîäà îí áûë èçáðàí êàíäèäàòîì â ÷ëåíû ÖÊ, ÷åðåç ãîä ñòàë ÷ëåíîì ÖÊ ÊÏÑÑ.  óñëîâèÿõ íà÷àâøåéñÿ ãîíêè âîîðóæåíèé è ïåðñïåêòèâû õîëîäíîé âîéíû îí ñíîâà áûë íóæåí Ñòàëèíó.
Ðåäàêòîð èçäàòåëüñòâà "ÀÏÍ" Ìèðêèíà Àííà Äàâèäîâíà, ðàáîòàâøàÿ ñ Æóêîâûì íàä ðóêîïèñüþ åãî áóäóùåé êíèãè, ñïðîñèëà ó ìàðøàëà:
— Ãåîðãèé Êîíñòàíòèíîâè÷, êàê ìîãëî ïîëó÷èòüñÿ, ÷òî ïîñëå âñåãî, ÷òî âû ñäåëàëè, Ñòàëèí îòïðàâèë âàñ â Îäåññó, à çàòåì â Ñâåðäëîâñê?
Æóêîâ ñïîêîéíî îòâåòèë:
— Çàâèñòü ê ìîåé ñëàâå. À Áåðèÿ âñÿ÷åñêè ýòî ÷óâñòâî ïîäîãðåâàë. Ïðèïîìíèëè è ìîþ ñïîñîáíîñòü âîçðàæàòü Ñòàëèíó.
— À âû òåïåðü ïðîñòèëè Ñòàëèíó òî, ÷òî îí òàê íåñïðàâåäëèâî ñ âàìè ïîñòóïèë?
— ß ïðîñòî ýòî âû÷åðêíóë èç ñâîåé ïàìÿòè. Îí ñäåëàë íåêîòîðûå øàãè äëÿ ïðèìèðåíèÿ: ÿ ñòàë êàíäèäàòîì â ÷ëåíû ÖÊ, îí ïîñëàë ìåíÿ ñ âèçèòîì â Ïîëüøó. Äóìàþ, ÷òî îí õîòåë íàçíà÷èòü ìåíÿ ìèíèñòðîì îáîðîíû, íî íå óñïåë, ñìåðòü ïîìåøàëà.