Своего хорошего мнения о вожде композитор не изменил даже тогда, когда в 1952 г. по делу «врачей-вредителей» был арестован его двоюродный брат — профессор-уролог Л. Дунаевский, а сам он едва не стал одной из многочисленных жертв «борьбы с космополитами». «Наивная и страстная душа», Дунаевский полагал, что цинизм и безнравственность существуют в нашем обществе не благодаря Сталину, а вопреки ему. Можно ли это поставить ему в вину? Эренбург в мемуарах пишет: «Мы думали (вероятно, потому, что нам хотелось так думать), что Сталин не знает о бессмысленной расправе с коммунистами, с советской интеллигенцией... »

Некоторые современные критики считают, что песни Дунаевского были «опиумом» для народа. В качестве примера приводят «Марш энтузиастов». Однако на песни Дунаевского ополчаются обычно литераторы, а не музыканты. Их раздражает прежде всего текст, сквозь призму которого они воспринимают музыку. Музыканты же восхищаются художественным совершенством музыки... Позднее «Литературная газета» писала: «Случалось, что в песнях Дунаевского слова лгали, но музыка — никогда. Она выжила благодаря своему благородству».

Несмотря на славу и популярность, сам-то композитор дышал не очень вольно. Например, за рубеж его не пускали. Один раз выпустили на короткое время в Чехословакию — там снимался фильм «Весна», к которому он писал музыку. И больше — никуда. К концу жизни Дунаевскому невыразимо тяжело было сознавать, что он долгие годы находился в положении художника, которого никуда «не пущали».

В медицинском заключении говорилось, что причина смерти — сердечная недостаточность. Между тем в народе стали упорно распространяться слухи о том, что композитор покончил с собой из-за какой-то темной истории, связанной с его сыном Евгением. Сам Е.И. Дунаевский рассказывает: «7 ноября 1951 г. поехал со своими сокурсниками отмечать праздники на дачу во Внуково. А там — ночью, пока я спал, — так называемые друзья выкрали у меня ключи от машины, сели в нее и поехали кататься. А ездили они плохо, машина разбилась, при этом погибла девушка (студентка 3 курса ВГИКа Зина Халеева). Поскольку машина была оформлена на меня, мне, как морально ответственному, и, пришлось за все отвечать»

После войны Дунаевского стали сильно травить. В печати появлялись инспирированные статьи с обвинениями в эпигонстве, в подражании Западу. В 1948 году в печально знаменитом постановление ЦК "Об опере "Великая дружба" досталось и Дунаевскому. Кроме всего прочего, его стали обвинять в том, что своим творчеством он недостаточно способствовал победе в Великой Отечественной войне. Хотя чего стоит одна лишь "Дорогая моя столица, золотая моя Москва" - песня, написанная во время войны!