Это ещё может оказаться трудностью в запоминании последовательностей. У человека разные части кгм отвечают за формирование "общей картинки" ("целостного восприятия") и последовательностей. Если и читать учился не по слогам, а отдельными - но целыми - словами, то целостное восприятие лидирует. У меня так было в детстве. Я вообще в первом классе слоги на письме переставляла или писала слова задом наперед. Если оно так, и дело не в невнимательности - то достаточно научить видеть "портреты" слов и даже предложений, чтобы слоги и слова "выглядели правильными". Мне тогда оно помогло.