В Красной Армии с 1942 года.

В 1942 году окончил школу связистов. Участник Великой Отечественной войны с февраля 1943 года. Участник Курской битвы.

9-го августа 1943 года, выполняя работы по восстановлению линий связи, поврежденных в ходе Орловской наступательной операции, гвардии сержант Банцекин был окружен отрядом противника. Приняв бой, отважный связист уничтожил 9 гитлеровцев и пробился к своим.

Через день, 11 августа, при форсировании Десны наладил телефонную связь через реку. Наткнувшись на минное поле, обезвредил 32 мины, не имея при себе никаких саперных средств.

За минным полем обнаружил и уничтожил огневую точку противника. Таким образом, гвардии сержант Банцекин в одиночку создал плацдарм на правом берегу Десны и удерживал его до прихода своего батальона.

В дальнейшем, в боях у деревни Кулаковка, В. Н. Банцекин уничтожил ещё 17 солдат противника.

В ноябре 1943 года гвардии сержант Банцекин пропал без вести.

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 15 января 1944 года гвардии сержанту Банцекину Василию Николаевичу присвоено звание Героя Советского Союза.

В парке города Сызрань на Доске героев-сызранцев помещен портрет В. Н. Банцекина. На заводе, где работал Герой, создан уголок памяти.

Награждён орденом Ленина, медалью «Золотая Звезда», медалью «За отвагу».