[i] Дарвин писал, что его теория происхождения видов доказывает наличие микро-эволюции, то есть изменений внутри видов и объясняет её. Но она совсем не доказывает наличие макро-эволюции, то есть эволюцию одного вида в другой.

Это, действительно, так. Нет эволюции между видами, есть параллельное развитие (усовершенствование) каждого вида или вытеснение одного другим, более сильным. Но это не отменяет сам процесс эволюции: http://www.liveinternet.ru/users/2979159/post93687865/