Для решения данной проблемы я бы порекомендовал воспользоватьс программой pocket divxencoder, там есть функция исправления синхронизации аудио и видео (при желании можно задать параметры синхронизации). Програмка относительно небольшая - весит около 6,77 Мб, но зато очень толковая и на русском языке (для кого-то это может иметь ключевое значение). Плюс ко всему заложены функции конвертации видео с DVD (VOB) и других форматов, а также возможность вырезать нужный фрагмент из потока видеофайла.