Монастырь был переведен от храма Спаса на Бору на нынешнее место в 1490 г. и получил название «Спас Новый», или Новоспасский. Первоначально все строения обители, кроме соборной церкви Преображения Господня, были деревянными, равно как и монастырские стены, выдержавшие набеги чужеземцев: крымских ханов Казы-Гирея (1571 г.) и Девлет-Гирея (1561 г.), а также польско-литовских интервентов. В Смутное время монастырь был разорен. В царствование государей Михаила Феодоровича и Алексея Михайловича обитель достигла своего расцвета. В эти годы в монастыре ведется большое каменное строительство (в связи с этим возле монастыря возникла целая слобода каменщиков, о существовании которой напоминают названия улиц: Большие и Малые Каменщики). На месте прежнего возводится новый Преображенский собор, выстроенный по образцу Кремлевского Успенского собора и освященный в 1649 г. До настоящего времени в соборе сохранился иконостас XVIII в. с иконами XVII в., уцелели настенные росписи. В храме пребывают частицы мощей прп. Серафима Саровского, ап. и ев. Марка, свт. Иоанна Златоуста, прмц. вел. кн. Елисаветы Феодоровны, других угодников Божиих. На северной стене западной части соборной паперти - остатки чтимого образа Спасителя (фреска). Кроме соборного Спасо-Преображенского храма в обители сохранились: церковь во имя свт. Николая Чудотворца (1652 г.), церковь Покрова Пресвятой Богородицы (1673-1675 г.), надвратная (в колокольне) церковь во имя прп. Сергия Радонежского (1759-1785 гг.), Знаменская церковь-усыпальница (1791-1795 гг.), под алтарем которой похоронены представители рода Шереметевых. Небольшая часовня у восточной стены монастыря указывает на место погребения подвижницы XVIII ст., невольной затворницы инокини Досифеи (в миру кн. Августы Таракановой) - дочери от тайного, но законного брака императрицы Елисаветы Петровны с гр. А. Г. Разумовским. Новоспасский монастырь сильно пострадал в 1812 г. Французы осквернили храмы, разграбили имущество окрестных жителей, укрытое под кровлей соборного храма. Наместник монастыря, престарелый о. Никодим, был подвергнут пыткам и лишь чудом остался жив. В те страшные дни на кладбище монастыря был похоронен замученный французами священник соседней церкви Сорока мучеников о. Петр Вениаминов (Гаврилов). После французского нашествия обитель быстро оправилась. В течение XIX в. ее храмы и другие здания неоднократно обновлялись. Большие работы проводились в преддверии 300-летия Дома Романовых: Новоспасский монастырь особенно почитался российскими государями из этой династии. В усыпальнице под Спасо-Преображенским собором похоронены царские прародители: мать царя Михаила Феодоровича инокиня Марфа, боярин Роман Юрьевич Захарьин - отец царицы Анастасии, Никита Романович Юрьев-Захарьин - отец Патриарха Филарета, другие представители рода Романовых и их родственники: Оболенские, Сицкие, Трубецкие, Ярославские, Нарышкины, Гагарины, Новосельцевы. Над входом в усыпальницу в начале XX в. был устроен портал в русском стиле с мозаичной иконой Нерукотворного Спаса. В годы, последовавшие за закрытием монастыря, когда на его территории разместили концлагерь, усыпальница Романовых подвергалась систематическому расхищению. В настоящее время захоронения в подклете Преображенского собора приводятся в порядок. 17 сент. 1995 г. в Новоспасский монастырь перенесены останки вел. кн. Сергея Александровича, убитого революционером Каляевым в 1905 г. в Кремле. Монастырь закрыли в 1918 г., а его строения обратили в концлагерь. Затем здесь размещался филиал Таганской тюрьмы, архив НКВД. Последний храм (Никольский) был закрыт в 1926 г. В кон. 1920 - нач. 1930-х гг. был полностью уничтожен монастырский некрополь. В 1991 г. Новоспасский монастырь возвращен Русской Православной Церкви. 22 марта 1991 г. состоялось малое освящение Спасо-Преображенского собора. В монастыре 6 иеромонахов, 8 иноков, 8 послушников. Монастырский хор под управлением игум. Митрофана по праву считается одним из лучших в России. При монастыре действует воскресная школа, школа иконописи. Для богомольцев открыта иконная и книжная лавка. Начата собственная издательская деятельность трудами архим. Иннокентия Просвирина, который жил в Новоспасском монастыре на покое, здесь же похоронен († 12 июля 1994). Святыни храма: Мощевик с частицами мощей свт. Спиридона Тримифунтского, вмч. Пантелеимона, вмц. Варвары, свт. Димитрия Ростовского, свт. Феофана Затворника, св. Московских Петра, Алексия, Ионы, Филиппа, Тихона, Иннокентия и Филарета, прп. Серафима Саровского и др., Мощевик с частицами мощей Киево-Печерских святых, Выносной резной крест с мощами Владимирских святых, Чтимая икона Смоленской Божией Матери, вклад инокини Марфы, матери царя Михаила Феодоровича, Икона Божией Матери Всецарица, список с афонского образа, Икона мц. Татианы с частицей мощей. Монастырь основан около 1330 г. при великом князе Иване Калите. Здесь покоятся предки царственного дома Романовых, находится усыпальница инокини Досифеи (Августы Таракановой, дочери Елизаветы Петровны).