Кроме того, внедряется система оценки налоговых рисков на основе среднеотраслевых индикаторов и реализуется концепция автоматизированной системы управления рисками при налоговом контроле за возмещением НДС (АСК НДС).

В своем докладе Мишустин также напомнил, что в последние годы Служба строит свою работу на основе передовых подходов к обработке информации и IT-инфраструктуры. Ряд технологических и организационных функций, не свойственных ФНС России, уже переданы из территориальных налоговых органов в специально созданное ФКУ "Налог-Сервис". По результатам I полугодия 2013 года 72% документов налоговой и бухгалтерской отчетности в РФ уже обрабатывается в ФКУ Налог-Сервис ФНС России. К концу 2013 года эта функция полностью будет выполняться силами ФКУ Налог – Сервис. Что касается развития сайта ФНС России, то изучив мнение различных категорий пользователей и ориентируясь на лучшие мировые практики, ведомство Мишустина уже ведет работу по разработке новой структуры интернет-сайта, чтобы сделать его более удобным для пользователей.