Я все делал сам- и визу, и билеты. В Чехии меня встречали. Агентств на самом деле много. Советую заглянуть на http://www.prag.ru Тур и гостиницу надо выбирать, исходя из интересов, времени, компании и, конечно, финансов.
Будут вопросы- пиши в личку. С радостью помогу.