могу ответить на полном серьезе и с ходу, поскольку знаю.
Референдум провели в такое время, когда основная часть электора, который бы протестовал был вне города. Я, кстати, не был сторонником переименования. Впрочем, у нас и так никто Петербургом не называет. Питер он и есть Питер, как не назови.