У меня например перпендикулярно прогоняется :) т.е. через крышку с решеткой и выходит либо через решетку сзади или через отверстия в другой крышке, у меня кулеры тихие и мне на шум немного наплевать ) а чтобы лучше прогонялся воздух вроде может помочь дополнительный кулер на заднюю стенку, только нужно знать размеры решетки и брать кулер по размерам (90х90мм 80х80мм ...) и искать на мамке свободные штыри для подключения кулера.