"APT просто выкачивает отсутствующие из сети и устанавливает ОТДЕЛЬНО..."
И слава Богу, что он это делает ОТДЕЛЬНО. Их также ОТДЕЛЬНО можно потом удалить или использовать с другой программой, не страдая по поводу того, что их СНОВА надо выкачать, чтобы поставить что-то еще.
"А тут совсем другой смысл. Фактически любое так ими собранное приложение становиться кроссдистрибутивным,не требующим ничего."
Что мешает собирать приложения статически, без использования библиотек? Любое ли приложение станет кроссдистрибутивным? Посмотри внимательно на VMWare, например. Будет таскать с собой еще и ядра?
Здесь мы наблюдать будем забивание винчестера хламом. Вторую винду. Слава Богу, еще эти библиотеки и приложение лежат и на винте в одном пакете, подключаясь как виртуальная файловая система и удалятся вместе с ней. Но сколько весят эти либы? Дистр ОпенОффиса со всеми либами объемом в 600 мегабайт не пугает? А ведь это будет реальностью! Можно будет забыть о маленьких и удобных программах, которые можно скачать за 1-2 минуты по модему. Теперь все они будут тянуть за собой либы, и неважно, есть либы уже в системе или их нет. Кроме того - все ли зависимости ты запихнешь в пакет? Вряд-ли =). С тем же опеноффисом теперь будет идти ява, иксы, система проверки орфографии (причем не та, которую хочу я)? Спасибо, не надо.