Читал два года назад, говорю насколько помню. Кысь - воплощение иррационального страха (перед чем угодно). Концовка книги такова, потому что другого благополучного исхода событий автор не видит, а плохой конец испортил бы книгу, превратив ее в мрачную антиутопию.