Видно, что автор статьи на стороне студентов... Возможно, прав преподаватель - студенты просто отказывались учить предмет. Конечно деканат мог давно решить проблему - например, ввести дополнительные курсы для религиозных студентов (с привлечением сторонних специалистов). Мало материала для выводов.
P.S. Не люблю местечковые УЗы - там со стороны препсостава можно столкнуться с любым уровнем мракобесия...
Хотя, судя поэтому: http://www.expert.ru/printissues/russian_reporter/2008/10/news_obvinen_dekan/
мракобесие может быть, где угодно...