А на самом деле описанное раньше - это не майнд мэпы, а концепт мэпы (concept map), только вот все найденные мною реализации построены от работы с семантической сетью, а не от документов...
А если призадуматься, то каким же полезным мог бы стать инструмент, позволяющий структурировать текст. Конечно, для гуманитариев это лишнее... для них текст имеет не только структуру, но и что-то большее, помимо предложений, описывающих объекты реальности и взаимоотношения между ними в их текстах всегда находится что-то большее...
Нечто лежащее за пределами анализа, тяготеющее к синтезу... В терминах объектов и связей, их текст всегда тянется связями к тем "объектам" в читателе, наличие которых неочевидно ему, но очивидно автору. И хорош тот автор, что попадает пальцем в реально существующие кусочки личности читателя.

Если же вернуться к нанизыванию документов на объектную модель, то вот что получится с постановкой задачи:

1. Имеется фонд документов (xhtml), обеспечить покрытие (мат. термин) его блоками и привязку блоков к элементам объектной модели.
2. Построить или адаптировать инструмент формирования объектных моделей, возможно, на основе стандарта UML.
3. На базе решений пунктов 1,2: обеспечить устойчивость системы к внешним изменениям привязанных к объектной модели блоков из документов.
4. Реализовать инструменты совместной конкуретной разработки элемнтов объектной модели и документов.
5. Рассмотреть и реализовать возможности по автоматическому посторению документов на основе существующей системы привязок и объектной модели, описывающих то или иное множество объектов.

Очень близок к этому проект www.wikimindmap.org