Медицинские эксперименты в концлагерях проводились только с ведома и разрешения самого Гиммлера.
Самое непосредственное участие в опытах над узниками принимали монополии, особенно "ИГ Фарбениндустри", а также множество научных институтов, не имевших прямого отношения к СС. Начиная с 1943, опыты начали проводиться с санкции Небе, начальника пятого управления РСХА. В самих концлагерях буквально весь медицинский персонал был участниками опытов. Для экспериментов возводились бараки в некотором отдалении от остальных бараков. С течением времени у каждого концлагеря появилась своя "специализация".

В Бухенвальде в основном занимались разработкой противотифозной вакцины. Ответственным за данные опыты был институт гигиены войск СС. Непосредственно участвовали штандартенфюрер СС доцент Марговски, имперский фюрер здравоохранения, статс - секретарь группенфюрер СС Конти. В Бухенвальде проводились также и другие эксперименты - опыты по заражению желтой лихорадкой, оспой, паратифом, дифтеритом. Экспериментировали с отравляющими веществами. И, наконец, пересаживали узникам половые органы, якобы для борьбы с гомосексуализмом. Руководили этими опытами штурмбанфюрер СС Шульце и оберфюрер СС Попендик.

В Дахау специализировались на малярии. С января 1942 гаупштурмфюрер СС, доктор Плетнер отбирал "абсолютно здоровых людей" в возрасте от 20 до 45 лет и заржал их малярией.

С 1943 по 1945 узникам в Дахау делали прививку, чтобы вызвать у них флегмону.

С 1941 в Дахау также проводились эксперименты по выяснению воздействия перепадов давления на человека, а с октября 1942 опыты по "охлаждению" людей. Руководил этими опытами штабной врач люфтвафе (позже унтерштурмфюрер СС) Рашер.

В концлагере Равенсбрюке узницам вводились стафилококки, возбудители газовой гангрены и столбняка, а также одновременно несколько видов бактерий, чтобы установить эффективность сульфаниламидных препаратов. Непосредственно руководил экспериментами профессор Гебхард Также в Равенсбрюке занимались трансплантацией костной ткани. В Заксенхаузене на узниках испытывали отравляющие вещества. В Найцвелере была широко распространена вивисекция. Также здесь экспериментировали с желтой лихорадкой, сыпным тифом. С конца 1942 в Найцвелере работал профессор Хирт, который "создавал" коллекцию черепов и скелетов "еврейско - большевистских комиссаров". В Освенциме проводили эксперименты по стерилизации, здесь выделились врач - венеролог Покорни, Шуман и профессор Клауберг. Кроме того, в Освенциме проводились "генетические эксперименты по созданию чистой арийской расы" под руководством гауптштурмфюрера СС Иозефа Менгеле. Также, под руководством Менгеле в лагере проводились эксперименты с отравляющими веществами.