Ни в коем разе не любое. Но если при установке системы дерево портов НЕ ставилось вообще, то поставить его можно проще простого:
sudo portsnap fetch extract

Да в общем-то если и ставилось, проще снести его нафиг и поставить свежачок:
sudo rm -rf /usr/ports/*
sudo portsnap fetch extract

А потом рекомендуется регулярно обновлять порты (хоть руками, хоть записав соотв. команду в кронтаб, но в кронтабе, разумеется, sudo не нужно):
sudo portsnap fetch update

Сразу уточняю: в каталоге /usr/ports/distfiles будут лежать ВСЕ архивы с исходниками портов, требующиеся для сборки, так что каталог может разрастаться и требовать чистки (я лично чищу лишнее с помощью portsclean). При желании, конечно, можно и вручную собирать что угодно, в т.ч. и с гита, но ИМХО это не совсем целесообразно, т.к. вносит нездоровую путаницу в содержимое системных каталогов. 8-)
И да, появление свежих версий уже установленных портов удобно время от времени отслеживать командой
pkg version -v | grep "<"