Спасибо большое!
Наша эпопея завершилась позитивно: http://blog.alexkrylov.ru/post99472812
Теперь с удовольствием пользуюсь программой и уже получил новую версию, в которую включены мои профили.
Однако Новосиб многое объясняет. Интересно, чего это они на родной мове со мной не общались? Я своё место обитания не скрывал.

А вот что им стоит конкретно улучшать, так это интерфейс — неудобно сравнивать, медленно и т. п. Впрочем, об этом в качестве предложения я им уже написал.