Чтобы вернуть себе права на папки, нужно проделать следующее:
щелкнуть на меню "свойства" интересуемой папки с недостающими правами -> вкладка безопасность -> дополнительно -> владелец -> выбрать текущего пользователя, включить флажок "заменить владельца субконтейнеров и объектов" -> нажать окей, закрыть это окошко.
еще раз открыть свойства папки и добавить во вкладке "безопасность" себя, то есть учетную запись используемого пользователя и дать себе права на изменение.
при этом должен быть отключен простой общий доступ к файлам(панель управления\свойства папки\вкладка вид)

Для поиска дубликатов раньше использовал программку Need4Space, но последнее время за ней замечаются некоторые глюки при работе на свежеобновленных и особенно x64 операционках :(