проверь еще список загруженых в память DLL(я не знаю какой утилитой, раньше в Norton Utilities была такая фича, в сандре еще может быть). Просто есть приложения, которые тащят за собой свой собственный cygwin и если они загружены раньше, то твой bash может пытаться прицепиться к чужой dll-ке. И поиск по всем дискам на тему cygwin*.dll тоже не помешает.