а) При высокой нагрузке усиливается обмен веществ. Далее разогретые мышцы остывают, скорость обмена веществ и вывода продуктов метаболизма снижается. Накопившиеся продукты метаболизма (в первую очередь, молочная кислота) не выводятся с нужной скоростью, накапливаются, и оттого мышцы болят.

б) При присниженном обмене веществ молочная кислота выводяться медленно, но если при болях вновь совершить небольшую нагрузку (разогрев) на те же гркппы мышц, то кровоснабжение и скорость обмена веществ вновь увеличиться и боли существенно уменьшаться.

ЗЫ. Говорю это как бывшая бегунья, потому могу объяснить лишь приблизительно :) Извините, если путаюсь в терминах или объяснила что-то неточно :)