Я в парфюмерных магазинах встречала специальные атомайзеры (небольшие пустые флаконы для парфюма с пульверизатором). Обычно они раскручиваются и в них можно перепшикать парфюм без потерь. Я таким пользовалась - очень довольна!
При отсутствии такого, наверно, действительно можно перепшикать в чашу, а потом перелить во флакон-трубочку.
Вскрывать родной флакон я бы не стала.