Собственно все встроенные переключалки лучше отключить нах, ибо бажат.
Отключив, набиваем в консоли
sudo nano /etc/X11/xorg.conf
Находим в открывшемся списке раздел Section "InputDevice" (именно по клаве) и забиваем:
Section "InputDevice"
Identifier "Generic Keyboard"
Driver "keyboard"
Option "CoreKeyboard"
Option "XkbRules" "xorg"
Option "XkbModel" "pc105"
Option "XkbLayout" "us,ru"
Option "XkbVariant" ",winkeys"
Option "XkbOptions" "grp: alt_shift_toggle,grp_led:scroll"
EndSection

Сохраняем, выходим, перезапускаем иксы (Ctrl+Alt+BackSpace) и наслаждаемся: раскладка переключается по нажатию Shift+Alt, индикация - подсветкой ScrollLock на клавиатуре.