В мае 1918 года был арестован зять протоиерея Неофита - православный миссионер Николай Юрьевич Варжанский. Отец Неофит написал письмо Ленину с просьбой освободить Варжанского, напомнив ему, что служил в Симбирске вместе с отцом Ленина и был преподавателем его сестры, однако ответа не получил.