Ну, во-первых: мы не можем судить о религиозности египетских жрецов. Верили ли они, не верили, - это уже их дело. Но с сокращением их культов к ним перестали поступать средства, и у них отнимали работу, грубо говоря. Нельзя сказать про создание культа на пустом месте - культ Атона не был выдуман Эхнатоном. Это был старинный культ, который Атон решил возвысить до уровня государственной религии.
Во-вторых, - вера - личное дело...)
В-третьих: данных действительно нет. И мы не можем сказать, насколько Эхнатон "убрал идеологическую основу" у местных правителей (которые были в его правление не правителями, а наместниками, что важно - про самостоятельных номовых правителей можно говорить исключительно к архаичному периоду и периоду междуцарствий, когда каждый ном был самостоятельным государством. Так вот, почему он не убирал этой основы: Эхнатон заперся в Ахетатоне и сочинял гимны Атону. Весьма сомнительно, чтобы он ездил по стране и самостоятельно рушил храмы, - нет, он просто отказал культам в своей личной поддержке. Во всяком случае, мы не имеем источников, указывающих на его репрессии.