Каталоги:
каталог Yandex http://yaca.yandex.ru (регистрация) http://www.yandex.ru/advertising/catalog.html
каталог ODP http://www.dmoz.org/ (регистрация повышает результаты в Google) для регистрации надо зайти на страницу нужной категории в каталоге и найти ссылку "suggest URL" (справа вверху)
каталог Aport http://www.aport.ru/, регистрация - http://www.aport.ru/addurl.php или http://catalog.aport.ru/rus/add/AddUrl.aspx
каталог Mail.ru http://list.mail.ru/index.html (в прошлом List.ru) для регистрации надо зайти на страницу нужной категории в каталоге и найти ссылку "Добавить сайт"
 
Счётчики для рейтингов:
Rambler's Top100 http://top100.rambler.ru/top100/, регистрация - http://top100.rambler.ru/top100/top_add.shtml.ru
Rambler's TopShop http://topshop.rambler.ru/ (рейтинг интернет-магазинов), регистрация - http://topshop.rambler.ru/newid/new.html
 
Счётчики для статистики (лучше выбрать только один):
Бесплатный счётчик Liveinternet (мой выбор) http://www.liveinternet.ru/ (он же Rax www.rax.ru), регистрация - http://www.liveinternet.ru/add
Бесплатный счётчик HotLog http://www.hotlog.ru/, регистрация - http://www.hotlog.ru/cgi-bin/hotlog/register
Платный счётчик SpyLog http://www.spylog.ru/, регистрация по планам: Персональный сайт, E-commerce, Средний бизнес, Крупный бизнес (бесплатный вариант Кроха - бесполезен, да и вообще spylog глючит часто)
Лично я использую cnstats 2.1 (небольшая штучка, ставишь ее на сайт, инсталлируешь и наслаждаешься кучей отчетов, крутой статистикой и т.д., даже можно сделать свою кнопку и выводить на нее статистику. есть и новая 2.4, но она платная, поэтому пользуюсь 2.1 ) - рекомендую! ссылка - http://boris.rostovbiz.ru/download/files/cnstats.rar 302кб
 
Поисковые системы:
Yandex http://www.yandex.ru/, регистрация - http://webmaster.yandex.ru/, советы (желательно их прочитать для общего ознакомления!) - http://www.yandex.ru/info/webmaster.html, удаление страницы - http://www.yandex.ru/removeurl.html
Rambler http://www.rambler.ru/, регистрация - http://www.rambler.ru/doc/add_site_form.shtml, советы - http://www.rambler.ru/doc/recommendations.shtml, определение позиции сайта - http://www.rambler.ru/doc/position.shtml
Aport http://www.aport.ru/, регистрация - http://www.aport.ru/addurl.php, советы - http://www.aport.ru/webmast.htm
Google http://www.google.com/, русский - http://www.google.com.ru/, регистрация - http://www.google.com/addurl.html (поиском от Google пользуются также Yahoo.com, Mail.ru и другие порталы!)
 
Пригодится также:
punto http://www.punto.ru/, регистрация - http://www.punto.ru/add
 
Для англоязычных очень нужно также:
Yahoo! http://search.yahoo.com/, расширенный поиск http://search.yahoo.com/search/options?fr=fp-top&p=, регистрация - http://submit.search.yahoo.com/free/request
(Поисковые системы AltaVista http://www.altavista.com/ и AlltheWeb http://www.alltheweb.com/ теперь также используют поисковую машину Yahoo!)
 
Сервисы подписки - автоматическое заполнение регистрационных форм:
1ps - рекомендую! - http://www.1ps.ru/
Registratura - только вчера узнал об этом ресурсе, еще не пользовался - http://www.registratura.ru/
Submitter http://www.submitter.ru/
AlfaInternet http://www.alfainternet.ru/
 
Контекстная реклама:
Яндекс Директ http://direct.yandex.ru/
Бегун http://www.begun.ru/ (в том числе - реклама в результатах поиска на Aport.ru)
Overture http://www.overture.com/, стоимость - http://uv.bidtool.overture.com/d/search/tools/bidtool/
Google AdWords https://adwords.google.com/select/
 
Баннерная реклама:
Баннерные сети на русском языке http://www.dir.ru/internet/banners/russian/
 
Анализ сайта:
Мне очень нравится http://www.be1.ru/stat/
http://www.siteposition.ru/
 
Анализ плотности слов на странице:
http://www.keywordcount.com/
 
Программы для раскрутки сайтов и контроля результатов:
SEO (Search Engine Optimization) Toolkit http://www.trellian.com/seotoolkit/index.html
WebTrafficGuru http://www.filebox.ru/p/webtrafficguru/
Web CEO http://www.webceo.com/
NetPromoter http://www.netpromoter.ru/
Мне нравится SEmonitor http://www.semonitor.com/rus/