Проблема в том, что Bash разработали 25 лет назад. До появления Apache оставалось ещё пять лет. Интернет уже существовал, но это был относительно закрытый клуб для представителей академической науки. Им пользовались учёные и исследователи из разных университетов. В то время безопасность не считалась важным приоритетом при разработке новых программ.

http://xakep.ru/shellshock-feature/