На самом деле никто специально координаты не выставляет, они выставляются сами, в зависимости от того, какие манипуляции с фракталом Вы производите. Координаты в уроке дают для того, чтобы получился такой же результат.
W - это приближение/удаление фрактала.

Вот смотрите, мы имеем общий вид фрактала, обратите внимание на параметр W



А теперь я его приблизила. Смотрите как параметр изменился



Чем глубже Вы будете проникать внутрь фрактала, тем меньше будет этот параметр

Давно собиралась написать такой урок, да всё руки не доходили. Пользуйтесь с удовольствием, Лариса!

Скорее всего размер изображения, которое Вы пытаетесь вставить меньше, чем изображение в которое Вы вставляете. Ну грубо говоря, Вы пытаетесь вставить картинку размером 300х300 пикс. в фрактал который имеет размер 500х500 пикс.
В уроке я говорила, что размеры должны совпадать "Теперь меняем размер изображения наших сердцевинок, он должен быть точно таким же как и размер картинки с цветочками. Это очень важно."

По поводу дубликата не совсем поняла. Мы его должны делать до того, как накладываем второй слой.
На самом деле эта программа не предусмотрена для работы с несколькими слоями, просто мы используем возможность наложении текстуры, как ещё один слой. Поэтому когда Вы дублируете фрактал, то дублируется только сам фрактал, а не текстура.