7.10.2006 г. Президент России В.В. Путин встретился с губернатором Петербурга В.И. Матвиенко. На встрече обсуждались вопросы дальнейшего развития Петербурга. В частности, сообщил В.В. Путин, правительство России рассматривает возможность организации в стране биржи нефти и нефтепродуктов. По предложению президента одним из мест размещения биржи мог бы быть Петербург. В.И. Матвиенко полностью поддержала предложение президента. По словам губернатора, лучше всего разместить биржу в родном историческом здании на Стрелке Васильевского острова, которое нуждается в серьёзном ремонте.
В итоге Военно-морской музей стали перемещать из здания Биржи в казармы на площади Труда, которые подходят для музея гораздо меньше, чем здание на Стрелке. Зачем его стали перемещать? Если для современной биржи не требуется такого размера центральный зал, такое гигантское здание, колоннада, стилобат и т.п. - все это уместно именно для музея великой морской державы. Видимо, затем, что в фантазиях лидеру нации грезился Храм нефти и бензина именно в форме древнегреческого культового сооружения.
Чем это закончилось - известно. Экономических условий для организации в Петербурге нефтяной биржи нет- это однозначно показали итоги девятимесячных торгов в Петербурге.
Но процесс запущен. И теперь музей бессмысленно переместят, Биржа опустеет, после чего встанет новая проблема: чем её занять? Наверное, отдадут под ещё один торгово-развлекательный комплекс.

Сначала планировалось к концу 2008 года построить новое здание Военно-морского музея в устье реки Смоленки. В марте 2007 года был объявлен конкурс на проектирование нового здания.
Но уже летом появилась информация о том, что администрация Петербурга намерена перевести Военно-Морской музей не в новое здание, а в старинные Крюковские казармы по соседству с Новой Голландией. Новое здание на намыве Васильевского острова в устье реки Смоленки для музея строить не будут. По словам главы КГИОПа Веры Дементьевой, особую ценность в Крюковских казармах представляют фасады и несколько входов, а внутри здание вполне можно приспособить для музея. По её прогнозу, полезную площадь казарм можно будет увеличить с 23 тыс. кв. м примерно до 30 тыс. кв. м за счёт перекрытия внутреннего двора, что позволит разместить в будущем музее даже "крупномерные" плавсредства. 25.5.2010 г. состоится презентация отреставрированного здания Крюковых казарм на площади Труда, №5. Скоро сюда переедет Военно-морской музей. К осени музей попрощается со зданием Биржи на Стрелке Васильевского острова. В 2011 году его планируют открыть уже на новых площадях. Какой объект разместится в бывшем здании Биржи, пока неясно. Товарно-сырьевая биржа, которая была главным претендентом на историческое здание, уже прописалась по другому адресу.